Una noche antes de las vacaciones de verano, Daichi Manatsu, un estudiante de secundaria, ve un extraño arcoíris redondo flotando en el cielo sobre la isla Tanegashima, y se dirige a ella solo. Ha visto el arcoíris antes. Con el recuerdo de la misteriosa muerte de su padre y del encuentro con dos misteriosos jóvenes, Daichi llega a la isla mientras suena la alarma del edificio llamado "Earth Engine". Mientras tanto, una forma de vida mecánica proveniente de Urano, llamada Kill-T-Gang, se aproxima a la tierra.
